Jokaisessa sarjassa jaetaan tuote- ja rahapalkintoja. Varsinaisen kärjen lisäksi palkitaan myös muita ansioituneita esityksia. Tuomaristolla on oikeus jakaa palkinnot myös toisin.
Nuori Huilisti- kilpailun tuote- ja rahapalkinnoista vastaa pääosin kilpailun pääsponsori Huilupiste yhdessä Suomen Huiluseuran kanssa. Palkinnot tarkentuvat lähempänä kilpailua.
